中国科学院昆明植物研究所
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研究生教育
生物化学与分子生物学专业
 

姓  名:
伊廷双
学  科:
生物化学与分子生物学
人才类别:
研究员
电话/传真:
0871-65223136  
电子邮件:
tingshuangyi@mail.kib.ac.cn
通讯地址:
云南省昆明市蓝黑路132号 650201
更多信息:
  
简历:

教育经历: 

1999.9-2002.7中国科学院昆明植物研究所,2002.7获得博士学位 

1996.9-1999.7中国科学院昆明植物研究所,1999.7获得硕士学位 

1992.9-1996.7山东师范大学生物系,1996.7年获得学士学位 

博士后/访问学者/访问教授: 

2012.7.9-2012.8.11,访问教授,东京大学Komaba Graduate School of Arts and Science 

2009.2-2009.4,访问学者,美国自然历史博物馆,史密斯研究所。 

2006.8-2006.9,访问学者,美国自然历史博物馆,史密斯研究所。 

2004.11- 2006.8,博士后,美国匹茨堡大学生物系。合作教授:Susan Kalisz博士。 

2002.11-2004.11,博士后,美国芝加哥Field 自然历史博物馆植物系。合作教授:Jun Wen博士。 

工作经历: 

2011.5- 研究员,中科院昆明植物研究所中国西南种质资源库。 

2006.10-2011.5,副研究员,中科院昆明植物研究所中国西南种质资源库。 

    主要从事植物分子系统发育和多样性、”iFlora”平台构建研究。与本所同事首次提出新一代“iFlora”(智能植物志)的发展目标(集成现代植物科学、DNA测序、超算和云计算等技术、现代信息化手段和技术,构建综合数据库平台,率先制定植物的国际综合识别和评价标准),列为研究所十二五的重大突破目标,希望能够引领植物科学数字化发展方向,为国家和科研服务。开展种子植物,尤其是固氮分支分子系统,物种多样化研究,对蔷薇科等类群的系统发育关系,北温带间断分布格局形成原因有重要贡献。主持国家自然科学基金海外及港澳学者合作研究基金、国家自然科学基金面上项目、中国科学院科技创新交叉与合作团队10余项研究项目,参加国家重大科学研究计划、国家自然科学基金重点项目、科技基础性工作专项重点项目等10余项研究项目。在Molecular Biology and Evolution, Proceedings of the National Academy of Sciences, New Phytologist, Molecular Phylogenetics and Evolution, Scientific Reports, American Journal of Botany, Taxon等本领域主流期刊发表研究论文50余篇;参加编写专著1部,译著1部。 

研究领域:

1. 植物分子系统发育基因组学 

  利用核、叶绿体和线粒体系统发育基因组学方法重建种子植物,特别是固氮分支及其分支内蔷薇科、豆科、鼠李科、大麻科等类群的生命之树,揭示主要支系和属种的分类范畴,系统发育关系,并利用系统发育原理研究基因组进化机制。 

2. 植物多样化 

  根据构建的系统发育树,结合古地质、古气候和化石证据推断类群的起源,现在分布格局形成的历史;研究物种多样化历史限制和驱动因子;探讨植物性状演化式样。 

3. 智能植物志“iFlora” 

  中国维管植物“iFlora”平台构建。对固氮分支,及该分支内的豆科、蔷薇科、鼠李科、大麻科等类群开展DNA条形码和组学数据为主的超级条形码(ultra-barcoding)研究。 

社会任职:
获奖及荣誉:

2012年度中国科学院王宽诚西部学者突出贡献奖。 

云南省中青年学术技术带头人后备人才(2011年入选)。 

代表论著:

代表作(*为通讯作者): 

1. Zhang Shu-Dong, Jin Jian-Jun, Chen Si-Yun, Chase W. Mark, Soltis E. Douglas, Li Hong-Tao, Yang Jun-Bo, Li De-Zhu*, Yi, Ting-Shuang*, 2017. Diversification of Rosaceae since the Late Cretaceous based on plastid phylogenomics. New Phytologist (http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.14461/abstract). 

2. Wang Yin-Huan, Qu Xiao-Jian, Chen Si-Yun, Li De-Zhu*, Yi Ting-Shuang*, 2017. Plastomes of Mimosoideae: structural and size variation, sequence divergence, and phylogenetic implication. Tree Genetics & Genomes (doi: 10.1007/s11295-017-1124-1). 

3. Yang Mei-Qing, Li De-Zhu, Wen Jun*, Yi Ting-Shuang*, 2017. Phylogeny and biogeography of the amphi-Pacific genus Aphananthe. PLoS ONE 12: e0171405.  

4. Qu Xiao-Jian, Jin Jian-Jun, Shu-Miaw Chaw, Li De-Zhu*, Yi Ting-Shuang*, 2017. Multiple measures could alleviate long-branch attraction in phylogenomic reconstruction of Cupressoideae (Cupressaceae). Scientific Reports 7: 41005. 

5. Xiang Yezi, Huang Chien-Hsun, Hu Yi, Wen Jun, Li Shisheng, Yi Ting-Shuang, Chen Hongyi, Xiang Jun, Ma Hong, 2017. Well-resolved Rosaceae nuclear phylogeny facilitates geological time and genome duplication analyses and ancestral fruit character reconstruction. Molecular Biology and Evolution 34: 262-281.  

6. Meng Jing, He Shui-Lian, Li De-Zhu, Yi Ting-Shuang*, 2016. Nuclear genetic variation of Rosa odorata var. gigantea (Rosaceae): population structure and conservation implications. Tree Genetics & Genomes 12: 65. 

7. He Shui-Lian, Wang Yun-Sheng, Li De-Zhu*, Yi Ting-Shuang*, 2016. Environmental and historical determinants of patterns of genetic differentiation in wild soybean (Glycine soja Sieb. et Zucc). Scientific Reports 6: 22795. 

8. He Shui-Lian, Yang Yang, Morrell L. Peter, Yi Ting-Shuang*. 2015. Nucleotide sequence diversity and linkage disequilibrium of four nuclear loci in foxtail millet (Setaria italica). PloS One 10: e0137088. 

9. Yi Ting-Shuang, Jin Gui-Hua, Wen Jun, 2015. Chloroplast capture and intra- and inter- continental biogeographic diversification in the Asian - New World disjunct plant genus Osmorhiza (Apiaceae). Molecular Phylogenetics and Evolution 85: 10-21.  

10. Xie Lei, Yang Zhi-Yun, Wen Jun*, Li De-Zhu, Yi Ting-Shuang*, 2014. Biogeographic history of Pistacia (Anacardiaceae), emphasizing the evolution of the Madrean-Tethyan and the eastern Asian-Tethyan disjunctions. Molecular Phylogenetics and Evolution 77: 136-146. 

11. Li Xiang, Peng Li-Yan, Zhang Shu-Dong, Zhao Qin-Shi, Yi Ting-Shuang*, 2013. The relationships between chemical and genetic differentiation and environmental factors across the distribution of Erigeron breviscapus (Asteraceae). Plos One: e74490.  

12. Yang Mei-Qing, van Velzen Robin, Bakker T. Freek, Sattarian Ali, Li De-Zhu, Yi Ting-Shuang*, 2013. Molecular phylogenetics and character evolution of Cannabaceae. Taxon 62: 473-495.  

13. Li Xiang, Zhang Shu-Dong, Yang Zhi-Yun, Song Ke-Xian, Yi Ting-Shuang*, 2013. Conservation genetics and population diversity of Erigeron breviscapus (Asteraceae), and important Chinese herb. Biochemical Systematics and Ecology 49: 156-166. 

14. He Shui-Lian, Wang Yun-Sheng, Volis Sergei, Li De-Zhu*, Yi Ting-Shuang*, 2012. Genetic diversity and population structure: implications for conservation of wild soybean (Glycine soja Sieb.et Zucc) based on nuclear and chloroplast microsatellite variation. International Journal of Molecular Sciences 1312608-12628. 

15. 李德铢, 王雨华, 伊廷双* (通讯作者), 王红, 高连明, 杨俊波,2012. 新一代植物志:iFlora. 植物分类与资源学报 34: 525-531. 

16. China Plant BOL Group, 2011. Comparative analysis of a large dataset indicates that ITS should be incorporated into the core barcode for seed plants. Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 108: 19641-19646. 

17. Meng Jing, Fougère-Danezan Marie, Zhang Li-Bing, Li De-Zhu*, Yi Ting-Shuang* , 2011. Untangling the hybrid origin of the ancient Chinese tea roses: evidence from DNA sequences of single-copy nuclear and chloroplast genes. Plant Systematics and Evolution 297:157-170.  

18. Zhang Shu-Dong, Soltis E. Douglas, Yang Yang, Li De-Zhu*, Yi Ting-Shuang*, 2011. Multi-gene analysis provides a well-supported phylogeny of Rosales. Molecular Phylogenetics and Evolution 60: 21-28.  

19. Xie Lei, Yi Ting-Shuang*, Li Rong, Li De-Zhu, Wen Jun *, 2010. Evolution and biogeographic diversification of the witch-hazel genus (Hamamelis L., Hamamelidaceae) in the Northern Hemisphere. Molecular phylogenetics and Evolution 56: 675-689. 

20. Meng Jing, Li De-Zhu, Yi Ting-Shuang*, Yang Jun-Bo, Zhao Xing-Feng, 2009. Development and characterization of microsatellite loci for Rosa odorata var. gigantea Rehder & E. H. Wilson (Rosaceae). Conservation Genetics 10: 1973-1976. 

21. Yi Ting-Shuang, Wen Jun*, Golan-Goldhirsh Avi, Parfitt E. Dan, 2008. Phylogenetics of Pistacia (Anacardiaceae) inferred from multiple molecular data sets. American Journal of Botany 95: 241-251.   

22. Yi Ting-Shuang, Miller J. Allison, Wen Jun*, 2007. The phylogeny of Rhus (Anacardiaceae) based on sequences of nuclear NIA-i3 intron and chloroplast trnC-D suggests reticulate evolution. Systematic Botany 32379-391. 

23. Yi Ting-Shuang, Li Heng, Li De-Zhu*, 2005. Chromosome studies on the genus Pinellia (Araceae). Botanical Journal of the Linnean Society 147: 449-455. 

24. Yi Ting-Shuang, Miller J. Allison, Wen Jun, 2004. Phylogenetic and biogeographic diversification of Rhus (Anacardiaceae) in the Northern Hemisphere. Molecular and Phylogenetic Evolution 33: 861-879. 

25. Yi Ting-Shuang, Lowry II P. Porter, Plunkett M. Gregory, Wen Jun, 2004. Chromosomal evolution in Araliaceae and close relatives. Taxon 53: 987-1005. 

专著 

1. He San-An, Yi Ting-Shuang, Pei Sheng-Ji, Huang Hong-Wen, 2013. Crop plants and their wild relatives. In: Hong De-Yuan and Stephen Blackmore (eds.), Plants of China, A companion to the Flora of China. Science Press, Beijing, pp. 309-323. 

2. Yi Ting-Shuang, Morell L. Peter, Pei Sheng-Ji, He Shan-Aan, 2013. Major introduced economic plants. In: Hong De-Yuan and Stephen Blackmor (eds.), Plants of China, A companion to the Flora of China. Science Press, Beijing, pp. 357-382.

3. 李德铢等2012. 植物系统学Plant Systematics: A Phylogentic Approach. 北京:高等教育出版社。(伊廷双负责305-409页)。

承担科研项目情况:

1. 2016.01- 2020.121,000,000。中科院中-非联合研究中心项目:《肯尼亚植物志》编研。子课题名称:《肯尼亚植物志》中蔷薇目(Rosales)等类群植物的分类研究和志书编写(子课题负责人:张书东;课题参加人)。 

2. 2016.05-2017.05,¥400,000。环境保护部-生物多样性保护专项。三个重要药用类群DNA条形码鉴定系统构建 (项目负责人) 

3. 2016.08-2016.12, 28,6000, 云南药山国家级自然保护区药用植物资源专项调查与开发利用 (课题主持人:张书东) 

4. 2014.01-2017.121,200,000西南山地典型生态系统植物多样性对气候变化的响应。国家重大科学研究计划项目(项目批准号:2014CB954100;项目负责人:李德铢)。第一课题:植物多样性格局与气候要素的耦合关系(课题负责人:陈之端;课题参加人)。 

5. 2013.01-2015.12,¥1,000,000。非洲资源植物种子库建设中国科学院中-非联合研究中心资助项目(项目批准号:SAJC201302项目负责人) 

6. 2013.01-2017.12,¥1,200,000。《中国植物志》的数字化和DNA条形码。科技基础性工作专项重点项目(项目批准号:2013FY112600; 项目负责人: 张宪春,王红)。子课题:203E维管植物属iFlora构建(子课题负责人)。  

7. 2013.01-2015.12,¥1,000,000iFlora交叉与合作团队。中国科学院科技创新交叉与合作团队(项目批准号:31129001项目负责人)。 

8. 2013.01-2016.12,¥900,000大麻科分子系统发育和多样化时空格局重建。国家自然科学基金面上项目。(项目批准号:31270274项目负责人)。 

9. 2011.01-2014.12,¥60,000云南省中青年学术技术带头人后备人才(项目批准号:2011CI042项目负责人)。 

10. 2012.01-2015.12,¥1,200,000。东亚-北美间断植物类群的分子系统学和生物地理学。国家自然科学基金海外及港澳学者合作研究基金(项目批准号:31129001项目联合负责人)。 

11. 2011.1-2013.12 350,000野生大豆亲缘地理学与保护生物学研究。国家自然科学基金面上项目(项目批准号:31070193项目负责人)。 

12. 2009.1-2014.12, 200,000。东亚-北美间断植物类群的分子系统学和生物地理学。国家基金海外及港澳合作研究基金(项目批准号:30828001项目联合负责人)。 

13. 2009.1-1012.12, 150,000。西部药用植物资源可持续利用研究。中国科学院知识创新工程领域前沿重点项目。(项目负责人:赵勤实、李唯奇)。子课题:灯盏细辛(灯盏花)分子鉴定与种质资源评价(课题负责人)。 

14. 2009.1-2012.12,¥450,000。生命之树共生固氮植物支系重要类群的起源、分化和环境制约。国家自然科学基金重点项目(项目批准号:40830209;项目负责人:李德铢; 项目参加人)。 

15. 2009.1-2010.12,¥25,000。《中国植物志》(英文版)编写项目(项目批准号:1ZO9103112B1项目负责人)。 

16. 2009.1-2009.12,¥300,000。云南省创新团队(项目负责人:李德铢; 项目参加人)。 

17. 2009.1-2009.12,¥50,000。中科院生物多样性与生物地理学重点实验室资助课题(课题负责人)。 

18. 2008.1- 2010.12,¥300,000。漆树科北温带间断分布关键属的分子系统学和生物地理学研究。国家自然科学基金面上项目(项目批准号:30770138项目负责人)。 

19. 2008.1-2010.12,¥1,500,000,生命之树中固氮植物和鱼类重要支系的分子系统发育。中国科学院知识创新工程重要方向项目(项目批准号:2007311002;项目负责人:陈之端;项目参加人)。 

20. 2007.11.28-2011.7.9,¥130,000。西南地区重要野生植物种质。国家专项任务(大科学工程、空间专项等)项目(项目批准号:1Z2005DKA21006子课题负责人)。 

21. 2007.1-2011.12, 20,0000。中国-喜马拉雅地区生物多样性演变和保护研究。国家973项目(项目负责人:张亚平;项目批注号:2007BC411600)。课题:重要生物类群的演变与地理格局(课题批准号:2007CB41160;课题负责人:李德铢;课题参加人)。 

22. 2006.11.15-2009.11.30,¥300,000,中国栽培作物起源与进化。中国科学院昆明植物所海外引进人才启动经费(项目批准号: 51O606571421 项目负责人)。 

23. 2006,¥20,000。王宽诚教育基因回国人员专项经费(项目负责人)。 

24. 2006  $5,000, 美国自然科学基金(植物分子和器官发育研究,博士后培养基金) 项目负责人)。 

25. 2002-2005,¥230,000,天南星科半夏属的系统学和生物地理学研究。中国自然科学基金面上项目(项目批准号:No. 30170067项目主要参加人) 

26. 2002-2005    50,000,天南星科半夏属的系统学和生物地理学研究。云南省自然科学基金面上项目 (项目批准号:No. 2001c0056M项目主要参加人) 

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